AAD agent antiviral direct
AAF fimbriae d’adhésion et d’agrégation
ALAT alanine aminotransférase
ARS agence régionale de santé
ARV antirétroviral
ASAT aspartate aminotransférase
ASC-US Atypical Squamous Cells of Undetermined Significance
ASLO anticorps anti-streptolysine O
BAAR bacille acido-alcoolo-résistant
BCYE Buffered Charcoal Yeast Extract
BDP brossage distal protégé
BFP Bundle-Forming Pili
BGN bacille à Gram négatif
BHE barrière hémato-encéphalique
BHRe bactérie hautement résistante émergente
BK bacille de Koch
BLSE bêta-lactamase à spectre étendu ou élargi
BMPA Buffered céfaMandole Polymyxine Anisomycine α-cétoglutarate
BMR bactérie multirésistante
BPCO broncho-pneumopathie chronique obstructive
BU bandelette urinaire
C3G céphalosporine de 3e génération
CA-SFM comité de l’antibiogramme de la société française de microbiologie
CCFA Cycloserine-Cefoxitin Fructose Agar
CDT Cytolethal Distending Toxin
CE corps élémentaire
CeGIDD centre gratuit d’information, de dépistage et de diagnostic
CIN Cervical Intra-Epithelial Neoplasia
CLAT centre de lutte anti-tuberculeuse
CMB concentration minimale bactéricide
CMI concentration minimale inhibitrice
CMIA Chemoluminescent Microparticle Immuno Assay
CNR centre national de référence
CPK créatine phosphokinase
CPM colite pseudomembraneuse
CR corps réticulé
CRFs Circulating Recombinant Forms
CRP C-Reactive Protein
CSH cellule souche hématopoïétique
CZA ceftazidime avibactam
DTP diphtérie tétanos polio
ECAD E. coli à adhérence diffuse
ECBC examen cytobactériologique des crachats
ECBU examen cytobactériologique des urines
ECEA E. coli entéro-agrégatif
ECEH E. coli entérohémorragique
ECEI E. coli entéro-invasif
ECEP E. coli entéropathogène
ECET E. coli entérotoxinogène
ED examen direct
EDTA éthylène diamine-tétraacétique
EHEC E. coli entérohémorragique
EI endocardite infectieuse
EIA Enzyme Immuno Assay
EIEC E. coli entéro-invasif
ELISA Enzyme Linked Immuno-Sorbent Assay
EMB éthambutol
EPEC E. coli entéropathogène
ETEC E. coli entérotoxinogène
ETO échographie cardiaque transoesophagienne
ETT échographie cardiaque transthoracique
EUCAST European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing/Organisme européen d’uniformisation des pratiques de l’antibiogramme
FCU frottis cervico-utérin
GDH glutamate déshydrogénase
GEA gastro-entérite aiguë
GEU grossesse extra-utérine
GNA glomérulonéphrite aiguë
HAV virus de l’hépatite A
HBV virus de l’hépatite B
HCV virus de l’hépatite C
Hib Haemophilus influenzae de type b
HPV papillomavirus
HPV-HR et BR papillomavirus à haut et bas risque
HSH homme ayant des relations sexuelles avec des hommes
HSV herpès simplex virus
IAS infection associée aux soins
ICD infection à C. difficile
IDR intra-dermo réaction à la tuberculine
IGH infection génitale haute
IGRA Interferon Gamma Release Assay
II inhibiteur de l’intégration
IIM infection invasive à méningocoque
IIP infection invasive à pneumocoque
IN intégrase
INH isoniazide
INNTI inhibiteur non nucléosidique de la transcriptase inverse
INTI inhibiteur nucléosidique de la transcriptase inverse
IP inhibiteurs de protéase
IPA Invasive Plasmid Antigen
IPP inhibiteur de pompes à protons
IRES Internal Ribosome Entry Site
ISO infection du site opératoire
IST infection sexuellement transmissible
ITL infection tuberculeuse latente
IU infection urinaire
LAM lipo-arabinomananne
LBA lavage broncho-alvéolaire
LCR liquide céphalo-rachidien
LCS liquide cérébro-spinal
LCV Legionella Containing Vacuole
LGV lymphogranulomatose vénérienne
LJ Loewenstein-Jensen
LLO listériolysine O
LOS lipo-oligosaccharide
LPS lipopolysaccharide
LPV leucocidine de Panton et Valentine
LT toxines thermolabiles
LTR Long Terminal Repeats
MALDI-TOF Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation/Time of Flight
MALT Mucosa Associated Lymphoid Tissue
MDO maladie à déclaration obligatoire
MDR Multi Drug Resistance
ME membrane externe
MH Mueller-Hinton
MH-F Mueller-Hinton Fastidious Agar (pour : bactérie de croissance difficile)
MLS macrolide, lincosamide, streptogramine
MLSK macrolide, lincosamide, streptogramine et kétolide
MLST Multi Locus Sequence Typing
MWY Modified Wadowsky Yee Agar
NAD nicotinamide adénine dinucléotide
NFS numération formule sanguine
NGS séquençage de nouvelle génération
NSP Non Structural Protein
NT non typable
NTCP Na+-Taurocholate Co-transporting Polypeptide
OMA otite moyenne aiguë
ORL oto-rhino laryngologie
P protéase
PAC pneumonie aiguë communautaire
PAP Pili associé aux pyélonéphrites
PAVM pneumonie acquise sous ventilation mécanique
PBH ponction biopsie hépatique
PCR Polymerase Chain Reaction
PCT procalcitonine
PFLA pneumonie franche lobaire aiguë
PL ponction lombaire
PLP protéine liant les pénicillines
PNA pyélonéphrite aiguë
PNN polynucléaire neutrophile
PrEP Pre Exposure Prophylaxis
PRP polyribosyl ribitol phosphate
PSDP pneumocoque de sensibilité diminuée à la pénicilline
PTT purpura thrombotique thrombocytopénique
PVD pays en voie de développement
PZA pyrazinamide
QRDR Quinolone Resistance Determining Region
qSOFA Quick SOFA
RAA rhumatisme articulaire aigu
RCIU retard de croissance intra-utérin
RIF rifampicine
RPM rupture prolongée des membranes
RPR Rapid Plasma Reagine
RT (ou TI) activité transcriptase inverse
RUBV virus de la rubéole
RV rotavirus
RVS réponse virologique soutenue
SARM S. aureus résistant à la méticilline
SA semaine d’aménorrhée
SCN staphylocoque à coagulase négative
SDRA syndrome de détresse respiratoire aigu
SGA streptocoque du groupe A (par extension : Streptococcus pyogenes)
SGB streptocoque du groupe B
SHA solution hydroalcoolique
SHU syndrome hémolytique et urémique
SIDA syndrome d’immunodéficience acquise
SNC système nerveux central
SRI syndrome de reconstitution immune
SRO soluté de réhydratation orale
SSA Streptococcal Superantigen
ST toxines thermostables
ST 17 Sequence Type 17
TasP Treatement as Prevention
TDM tomodensitométrie
TDR test de diagnostic rapide
TIAC toxi-infection alimentaire collective
TK thymidine kinase
TME transmission mère-enfant
TNT test non tréponémique
TPE traitement post-exposition
TPHA réaction d’hémagglutination (Treponema Pallidum Hemagglutination Assay)
TROD test rapide d’orientation diagnostique
TSST-1 toxine du syndrome du choc toxique staphylococcique
TT test tréponémique
UFC unité formant colonie
UL Unique Long
URFs Unique Recombinant Forms
US Unique Short
VDRL Veneral Disease Research Laboratory
VHA virus de l’hépatite A
VHB virus de l’hépatite B
VHC virus de l’hépatite C
VHD virus de l’hépatite D
VHE virus de l’hépatite E
VIH virus de l’immunodéficience humaine
VPN valeur prédictive négative
VS vitesse de sédimentation
WB Western Blot
WGS Whole Genome Sequencing