AAD : agent antiviral direct
Ac : anticorps
ADN : acide désoxyribonucléique
ARN : acide ribonucléique
AES : accident d’exposition au sang
Ag : antigène
ALAT : alanine aminotransférase
ARS : agence régionale de santé
ARV : antirétroviral
ASAT : aspartate aminotransférase
ASC-US : Atypical Squamous Cells of Undetermined Significance
BAAR : bacille acido-alcoolo-résistant
BCYE : Buffered Charcoal Yeast Extract
BGN : bacille à Gram négatif
BHE : barrière hémato-encéphalique
BHRe : bactérie hautement résistante émergente
BLSE : bêta-lactamase à spectre étendu ou élargi
BMPA : Buffered céfaMandole Polymyxine Anisomycine α-cétoglutarate
BMR : bactérie multirésistante
BPCO : bronchopneumopathie chronique obstructive
BU : bandelette urinaire
C3G : céphalosporine de 3e génération
CA-SFM : Comité de l’antibiogramme de la société française de microbiologie
CMB : concentration minimale bactéricide
CMI : concentration minimale inhibitrice
CMIA : Chemoluminescent Microparticle Immuno Assay
CMV : cytomégalovirus
CPM : colites pseudomembraneuses
CSH : cellule souche hématopoïétique
dNTP : désoxyribonucléoside triphosphate
E-BLSE : entérobactérie productrice de bêta-lactamase à spectre élargi
ECAD : E. coli à adhérence diffuse
ECBU : examen cytobactériologique des urines
ECEA : E. coli entéro-agrégatif
ECEH : E. coli entérohémorragique
ECEI : E. coli entéro-invasif
ECEP : E. coli entéropathogène
ECET : E. coli entérotoxinogène
ED : examen directEI : endocardite infectieuse
EIA : Enzyme Immuno Assay
ELISA : Enzyme Linked Immuno-Sorbent Assay
EMB : éthambutol
EPEC : E. coli entéropathogène
EUCAST : European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing/Organisme européen d’uniformisation des pratiques de l’antibiogramme
FCU : frottis cervico-utérin
GDH : glutamate déshydrogénase
GEA : gastro-entérite aiguë
GEU : grossesse extra-utérine
GVPC : glycine vancomycine polymyxine cycloheximide
HA : hémagglutinine
HAV : virus de l’hépatite A
HBV : virus de l’hépatite B
HCV : virus de l’hépatite C
HDV : virus de l’hépatite D
HEV : virus de l’hépatite E
Hib : Haemophilus influenzae de type b
HIV : virus de l’immunodéficience humaine
HPV : Human Papillomavirus
HPV-BR : HPV à bas risque
HPV-HR : HPV à haut risque
HSH : homme ayant des relations sexuelles avec des hommes
HSV : virus de l’herpès simplex
IAS : infection associée aux soins
ICD : infection à C. difficile
IDR : intradermoréaction à la tuberculine
IFN : interféron
Ig : immunoglobuline
IGRA : Interferon Gamma Release Assay
IIM : infection invasive à méningocoque
IIP : infection invasive à pneumocoque
IN : intégrase
INH : isoniazide
INNTI : inhibiteur non nucléos(t)idique de transcriptase inverse
INTI : inhibiteur nucléos(t)idique de la transcriptase inverse
IP : inhibiteur de protéase
IPP : inhibiteur de pompes à protons
IST : infection sexuellement transmissible
IT : transcriptase inverse
ITL : infection tuberculeuse latente
IU : infection urinaire
LCR : liquide céphalorachidien
LCS : liquide cérébrospinal
LGV : lymphogranulomatose vénérienne
LOS : lipo-oligosaccharide
LPS : lipopolysaccharide
LPV : leucocidine de Panton et Valentine
LT : toxines thermolabiles
MALDI-TOF : Matrix Assisted Laser Desorption Ionisation/Time of Flight
MALT : Mucosa Associated Lymphoid Tissue
MDR : Multi Drug Resistance
MH : Mueller-Hinton
MH-F : Mueller-Hinton Fastidious Agar (pour : bactérie de croissance difficile)
MLS : macrolide-lincosamide-streptogramine
MWY : Modified Wadowsky Yee Agar
NA : neuraminidase
NAD : nicotinamide adénine dinucléotide
NGS : séquençage de nouvelle génération
NSP : Non Structural Protein
NT : non typable
OMA : otite moyenne aiguë
ORL : oto-rhino-laryngologie
PAC : pneumonie aiguë communautaire
PAVM : pneumonie acquise sous ventilation mécanique
PBH : ponction biopsie hépatique
PCR : Polymerase Chain Reaction
PFLA : pneumonie franche lobaire aiguë
PL : ponction lombaire
PLP : protéine liant les pénicillines
PNA : pyélonéphrite aiguë
PNN : polynucléaire neutrophile
PrEP : Pre Exposure Prophylaxis
PSDP : pneumocoque de sensibilité diminuée à la pénicilline
PTT : purpura thrombotique thrombocytopénique
PVD : pays en voie de développement
PZA : pyrazinamide
qSOFA : Quick SOFA
RAA : rhumatisme articulaire aigu
RCIU : retard de croissance intra-utérin
RIF : rifampicine
RT (ou TI) : activité transcriptase inverse
RT-PCR : Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction
RUBV : virus de la rubéole
RV : rotavirus
RVS : réponse virologique soutenue
SA : semaine d’aménorrhée
SARM : S. aureus résistant à la méticilline
SCN : staphylocoque à coagulase négative
SDRA : syndrome de détresse respiratoire aiguë
SGA : streptocoque bêta-hémolytique du groupe A (par extension : Streptococcus pyogenes)
SHU : syndrome hémolytique et urémique
SIDA : syndrome d’immunodéficience acquise
SNC : système nerveux central
SRO : soluté de réhydratation orale
TasP : Treatment as Prevention
TIAC : toxi-infection alimentaire collective
TK : thymidine kinase
TME : transmission mère-enfant
TNT : test non tréponémique
TPE : traitement post-exposition
TROD : test rapide d’orientation diagnostique
TSST-1 : toxine du syndrome du choc toxique staphylococcique
TT : test tréponémique
UFC : unité formant colonie
VIH : virus de l’immunodéficience humaine
VP : protéine virale/Viral Protein
VPN : valeur prédictive négative
VZV : virus de la varicelle et du zona
WB : Western Blot